Comandos para o programa Chime

Rotação nos eixos XY:
Posicione a seta do mouse na janela onde está a molécula de ATP. Mantenha pressionado o botão esquerdo do mouse e mova o cursor. Movimentos para cima/baixo giram a molécula em torno do eixo X, enquanto que movimentos para esquerda/direita giram a molécula em trono do eixo Y.

Rotação no eixo Z:
Com a seta na molécula de ATP, mantenha pressionada a tecla Shift; pressione o botão direito do mouse e mova o cursor para a esquerda ou direita.

Translação nos eixos XY:

Com a seta na molécula de ATP, mantenha pressionada a tecla Ctrl; pressione o botão direito do mouse e mova o cursor.

Zoom:
Com a seta na molécula de ATP, mantenha pressionada a tecla Shift; pressione o botão esquerdo do mouse e mova o cursor para cima (diminuir a imagem) ou para baixo (aumentar).

Molécula de ATP

 

O menú chime tem a aparência mostrada abaixo. Este menu é apenas uma ilustração, não sendo, portanto, funcional. Leia as instruções ao lado para usar o menu do Chime.

Este menu não é funcional

Pressione o botão direito do mouse com a seta posicionada na janela onde está a molécula do ATP. Um menu semelhante ao mostrado no quadro à esquerda deverá surgir. As opções Display, Options e Color são as mais úteis para a modificação das diferentes formas de visualização de uma mesma molécula. A opção Rotation liga/desliga o movimento de rotação da molécula. Experimente.
 



O esquema de cores CPK (Corey, Pauling, Kultin) tem sido utilizado desde os primeiros modelos de moléculas. Abaixo segue uma listagem completa das cores usadas para representar os diferentes tipos de átomos da tabela periódica.



Código de cores dos elementos químicos (CPK)

H He
Li Be B C N O F Ne
Na Mg Al Si P S Cl Ar
K Ca Sc Ti V Cr Mn Fe Co Ni Cu Zn Ga Ge As Se Br Kr
Rb Sr Y Zr Nb Mo Tc Ru Rh Pd Ag Cd In Sn Sb Te I Xe
Cs Ba L* Hf Ta W Re Os Ir Pt Au Hg Tl Pb Bi Po At Rn
Fr Ra A* Rf Db Sg Bh Hs Mt
 
  (L:) La Ce Pr Nd Pm Sm Eu Gd Tb Dy Ho Er Tm Yb Lu  
  (A:) Ac Th Pa U Np Pu Am Cm Bk Cf Es Fm Md No Lr  

CPK=Corey, Pauling, Koltun


Esquema de cores por carga eléctrica

-4   
-3   
-2   
-1   
0   
1   
2   
3   
4   
5   
6   
7   



  Cores por grupos (posição na cadeia)

N-terminal ou 5' C-terminal ou 3'
                                                                                                  



Cores por aminoácidos ou nucleotídeos

   Ala
   Arg
   Asn
   Asp
   Cys
   Gln
    
   Glu
   Gly
   His
   Ile
   Leu
   Lys
    
   Met
   Phe
   Pro
   Ser
   Thr
   Trp
    
   Tyr
   Val
   Asx
   Glx
   outros
   A
   G
   I
   C
   T
   U



Cores por estrutura secundária 

   α-hélice
   β-folha
   (β) volta
   outra
   DNA
   RNA